Safariの閲覧履歴、キャッシュ、Cookieは設定内から一括で削除することができます。

Safariのこれらを削除するにはまず、[設定]>[Safari]>[履歴とWebサイトデータを消去]の順にタップします。
次に消去する履歴の期間を選びます。履歴を全て消したい場合は[すべての履歴]を選びましょう。

[タブをすべて閉じる]をオンにするとSafariで開いているタブが全て閉じられてしまうので、残しておきたいタブがある場合はオフのままにしておきましょう。

最後に[履歴を消去]をタップすると削除完了です。